公元1521年四月二十一日，朱厚熜抵京登基，年號嘉靖。登基后的第六天，大臣張慎聯合眾臣上書，要求嘉靖尊孝宗為皇考，尊父親興獻王為皇叔考，母親蔣王妃為皇叔母。蔣王妃得知消息，勃然大怒，拒絕進宮，并且一病不起。李言聞照料太妃有功，被嘉靖封為九品吏目，徐長明被封為八品太醫。

在這場長達三年的“大禮儀”之爭中，朝中與嘉靖作對的大臣有的被貶官，有的被流放，更多的被杖斃。正直忠勇的李言聞為幾位杖刑受傷的大臣療傷，并且暗地里將杖刑致死“罪臣”張慎之子張行義收為養子，改名為李行義。這惹怒了蔣太妃，且被逐出京城。李言聞攜李時珍和養子李行義回到家鄉蘄州。