哪吒和姬發為保衛龍脈，在地下密室大戰石磯。勝負未定時，雙方在密室發現了盤古石，一方保護，一方爭搶，經過一番殊死搏斗，盤古石最終被擊裂，哪吒和石磯一人得到了一半。與此同時，山崩地裂，地下密室爆炸了。原來，盤古石正是龍脈的結晶，盤古石裂成兩半，大地經脈混亂，天下再無寧日。只有盤古石重新復原，天下才能太平。由此引出了整個第三部的故事。

姜子牙等人乘亂組織部分奴隸沖出了朝歌。哪吒和石磯兩敗俱傷，哪吒被氣流沖到歧山，所幸得到山鬼和龍須虎的細心照料。與此同時，石磯為控制天下，指派申公豹和妲己前往歧山偷盤古。