只要接觸到，就連精神也會被其侵蝕的第十六使徒，將綾波麗的零號機(jī)捕獲，而明日香因?yàn)橥街档拖露鵁o法操作二號機(jī)。于是，元渡啟動(dòng)凍結(jié)中的初號機(jī)去為麗解圍。但是，麗為了保護(hù)真嗣，開啟了自爆程序與使徒同歸于盡。而當(dāng)真嗣正為此痛苦的時(shí)候，麗又出現(xiàn)在他面前…… 當(dāng)夜，因被元渡出賣、意志消沉的律子，將真嗣與美里帶到了制造麗的器械面前……