在EVA的同步測試中，真嗣超越了明日香。因此，他信心百倍地去迎擊出現的第十二使徒，結果被使徒的虛像所迷惑，落入了使徒本體的虛數空間。由于無法脫離，真嗣將生命維持系統打開，等待救援。十六小時后，生命維持到達限界，在模糊的意識中，真嗣似乎看到了母親。另一方，律子打算犧牲真嗣來回收初號機，但使徒忽然被初號機撕裂開來。