莫采石怎么也想不到自己日夜守護的五九檔案會不翼而飛。當莫采石從哈金斯那里回到警察廳，打開保險柜不見了五九檔案，他驚恐萬分。

這時，程慈航打電話要見他，莫采石看到程慈航手中赫然拿著那個裝著五九檔案的鐵匣子。程慈航指責因為莫采石的愚忠，隱瞞了五九檔案，造成許許多多無辜的人為此失去生命，特別是歐陽倩尋找五九檔案的目的在于將之公布于眾，以懲罰日本戰犯。程慈航指出從一開始就是莫采石圍繞五九檔案設的騙局，目的在于給蔣介石政府和美國人談判增加一張籌碼。莫采石看程慈航把整個過程分析得清清楚楚，以保護程慈航為由，解釋隱瞞五九檔案的原因。程慈航感激莫叔叔能替自己著想，但是，五九檔案是日本侵略者在戰爭中用中國人做活體實驗的罪證，用五九檔案為籌碼和美國人談判無異于漢J行為。程慈航勸說親臨過抗日戰場而無所畏懼的莫采石想一想日寇的侵略暴行，勸莫采石要以民族大義為重，把五九檔案交給遠東國際法庭，將日寇罪行公之于眾。莫采石陷入深深的思索中，程慈航告訴莫采石，他精心守護的五九檔案不見得是真的，也可能是蔣介石舍車保帥的一個贗品。莫采石仔細回憶和五九檔案相關聯的每個細節，他終于明白，蔣介石早就派人把五九檔案調過包了。程慈航看到莫采石已有悔意，跪在地上請求他成全自己“茍利國家生死以，豈因禍福避趨之”的民族大義，幫助自己奪回五九檔案。程慈航這番慷慨陳詞、鏗鏘有聲的言語，深深打動了莫采石，莫采石找到了作為中國人的良心。他把視為生命的中正劍轉交給程慈航，然后，莫采石通知哈金斯來看五九檔案，借機把哈金斯抓了起來，他要給程慈航爭取寶貴的時間。自知無法交差的莫采石最后在辦公室自殺身亡，一代將星隕落。

這邊，中田命令小野緊跟程慈航，必須找到五九檔案。

程慈航手捧中正劍，拿著總裁手諭，進入靈谷寺藏經閣，以美國特使飛機就要起飛為由，阻止憲兵打電話向上峰求證，然后取出五九檔案。

霍然得知莫采石自殺的消息，知道程慈航將往藏經樓尋找五九檔案，他準備組織警力強行阻止程慈航。霍蜜兒聽到爸爸打的電話，意識到程慈航會有危險，為了程慈航，她控制住爸爸霍然，逼著司機把車開往靈谷寺。

霍蜜兒看到程慈航抱著鐵匣子走了出來，連忙讓司機停車。霍蜜兒剛剛下車，一直關注程慈航行蹤的中田就命令手下開槍，方捷和錦線弟子慌忙抵抗。混亂中，中田抓住了霍蜜兒，以此要挾程慈航把五九檔案交出來。程慈航答應中田，可以把五九檔案交給他，但是必須放了霍蜜兒。程慈航放下鐵匣子，狡猾的中田把霍蜜兒打翻在地，撿起箱子沖著程慈航扣動扳機，沒成想子彈已經打光了，眾人立即圍住了中田。國仇家恨，程慈航要親手殺了中田。他仿佛看到了小玉和歐陽倩等人慘死的景象，每一拳每一腳都充滿仇恨的力量，暴揍中田口吐鮮血而亡。程慈航趕忙跑到霍蜜兒身邊，一貫任性的霍蜜兒此時越來越虛弱，偎依在程慈航懷里慢慢地閉上了那雙美麗的眼睛。

一九四六年五月三日，遠東國際法庭，五九檔案作為不可或缺的有力證據，揭露了日本軍國主義犯下的滔天罪行，伸張了和平與正義。

有詩為贊：

莫采石中將為廳長，受重任終日心惶惶。

巧布局怎奈對手強，曉大義不再為虎倀。

程慈航冒險尋檔案，為民族雪恥美名揚。

國羸弱人民無尊嚴，求富強國恥不敢忘。

愿世界永遠充滿和平正義的陽光！！