歐陽倩讓關天平拿出莫采石讓程慈航親審皮三的指令，嚴達慶才怒氣沖沖地離開。繼續審問皮三得知，原來劉勇就是在Du場調戲歐陽倩，被程慈航教訓了一頓的那個痞子。這時，莫采石進來探聽消息，程慈航謊稱只是一些皮毛，沒發現其他線索。

警局內部暗流涌動，各方勢力勾心斗角。劉阿長向嚴達慶密報程慈航的動向，嚴達慶找到師傅霍然，抱怨莫采石一直暗中幫助程慈航幫助。霍然為自己把程慈航任命為獨立大偵探后悔不已，他讓嚴達慶放出一些假消息，干擾程慈航辦案，然后摸清程慈航的思路，再順著程慈航的思路偵查案件。得了主意的嚴達慶立即調集所有警力搜查劉勇，這時，歐陽倩遵照程慈航的安排把劉勇的畫像送了過來，便于刑偵隊四處搜查劉勇。

這邊，程慈航認為癮君子劉勇有可能待在煙館里吸食鴉片。歐陽倩找到師妹李麗蘭，讓她幫助自己查查劉勇的下落，不久就找到了劉勇的落腳之地。程慈航等人立即趕到濟昌茶館四周埋伏下來。這時，程慈航發現劉勇馬上要進入茶館，他們準備等劉勇進去再甕中捉鱉。不料，剛剛得到消息就從車站匆匆趕到的嚴達慶立功心切。鳴槍示警，劉勇匆匆逃到附近的宴福酒樓。程慈航搜查發現，有位女士神色極不自然。程慈航馬上要求顧客撤離出來，空蕩蕩的大廳里只剩那位神色不安的女士，原來他被劉勇用槍頂住腰部。眼看劉勇就要被圍上來的警察抓住，劉阿常假裝害怕碰落了桌子上的酒壺，受驚的劉勇立即劫持人質站了起來。嚴達慶根本不顧及人質死活，一直恐嚇劉勇。程慈航見此，急忙和歐陽倩分別從兩邊包抄過去。眼見程慈航將要活捉劉勇，嚴達慶唯恐程慈航搶了頭功，忙讓手下強攻。劉勇負隅頑抗，開槍射擊。劉阿常見勢不妙，一槍擊中劉勇，劉勇應聲倒地。眼見功虧一簣，再看嚴達慶不把弟兄們當回事，程慈航斥責嚴達慶。嚴達慶用槍指著程慈航，被程慈航一把扭過他的手臂讓他向大家賠罪，剛剛趕到的馬副官見勢不妙急忙拉開二人。

嚴達慶感到顏面盡失，大發雷霆。這時，自稱是三朝耗子的劉阿常小心翼翼地走了進來，嚴達慶對于這個給自己通風報信的舊警察漸生好感，讓他繼續盯著程慈航。

程慈航的所作所為讓莫采石隱隱感到擔憂。莫采石勸告程慈航不要因為和嚴達慶的矛盾讓自己這個堂堂的廳長為難。聽到這里，程慈航決定找霍總長澄清事實。同時，程慈航根據白天的事情，推測警察廳有人想故意制造混亂，此人可能是劉阿常。莫采石不同意程慈航把這事告訴霍然。

劉勇死后，五九檔案的線索好像一下子就消失了，一直覬覦五九檔案的各方勢力為此均不惜一切代價。程慈航和歐陽倩討論關于五九檔案的有關問題，他認為各方勢力都會把許老二當做目標。

歐陽倩陪著程慈航一起走回莫家，突然聽到院子里傳來怪異的聲音，程慈航發現有人偷偷地在窗戶上貼著膠帶，連忙喝止，黑衣人持刀行兇，被程慈航幾個回合就奪了過來。這時，在外面隱蔽的歐陽倩擔心程慈航的安危，巡視四周后發現無人，趕忙過來幫忙。誰料越幫越忙，突然出來幾個黑衣人，歐陽倩沖過去保護程慈航，自己被黑衣人刺傷。破案中的生死相依，讓他們擦除了愛情的火花。

外面不太平，莫家也不消停，莫采石很是不解。馬副官猜測應該是有人沖程慈航尋仇，馬副官欲言又止，暗示莫采石讓程慈航搬出去住。這時，程慈航回到家中，莫采石勸他為了這份檔案丟掉生命，不值過！程慈航告訴莫叔叔，凡是有良知的中國人都會用五九檔案揭露日本人的罪惡。這個年輕人的話讓莫采石沉思良久。

程慈航把歐陽倩等人找過來尋求新的線索，表情不太自然的歐陽倩讓劉阿常看出她和程慈航之間非同尋常的關系。劉阿常連忙借口肚子疼躲了出去。