自從南方仁陰差陽錯地來到了江戶時代之后已經過去了兩年。有一天，仁看到了橘咲的樣子有一些失落，很是在意，于是便登門拜訪，從咲的哥哥恭太郎那里得知，其母親榮得了腳氣。據恭太郎表示，幾天前咲因為擔心母親的身體而回到了家，卻因此而使得婚事告吹，榮為此感到很生氣，之后甚至都不允許其踏入家門。仁打算要幫助榮，考慮到其喜歡吃甜的東西，所以仁決定利用某種點心來治療她的腳氣……

某日，坂本龍馬為了向仁尋求幫助，特地從京都趕來。據坂本龍馬稱，勝海舟的師父佐久間象山遭人襲擊，身負重傷，處于瀕死的狀態。考慮到幫助對于時代有著巨大影響的重要人物，將很有可能會改變歷史，仁對此也是感到很困惑，不過他還是跟著龍馬來到了京都。在仁的竭力治療下，象山總算是保住了一條性命。就在此時，從意識恢復的象山口中，得知了一件驚人的事實……

之后仁便留在了京都，專心為那些在長州與薩摩的戰爭當中受傷的人們進行治療，卻不料又被突然出現的新選組帶走，來到了身在薩摩藩邸的西鄉隆盛的面前。西鄉身患蟲垂炎，必須要馬上切腹進行緊急手術，否則就將會有生命危險……