甄嬛身陷絕境，不料清河王突然出現，使皇帝明白驗血之水有詐。危機暫且化解。不過，沈眉莊受驚而死，溫實初立志守陵，安陵容被皇帝賜死，而幕后主使華妃只被禁足三月。

痛失姐妹，甄嬛悲憤而憂慮。自請出征剿滅華氏勢力的清河王，深夜暗訪甄嬛，送來安慰和愛意，并為皇侄取了小名。

滴血驗親計謀失敗的華妃，得知甄嬛和清河王相會，再度向皇帝告發。但已經決定啟用清河王剿滅華氏家族的皇帝，反而勃然大怒，將華妃打入冷宮。

清河王凱旋而歸，慶功宴上，皇帝重現笛韻舞姿，并用計探出了清河王對甄嬛的情愫。歌舞過后，皇帝命甄嬛毒殺清河王，否則，玉石俱焚。

桐花臺上，落英繽紛。甄嬛決意和清河王同死未成，自知必死的清河王得知皇侄身世真相，帶著欣慰和對甄嬛的深深愛意死去。甄嬛成為皇后，無限風光的背后卻是深深的憂傷。

一年后，鏟除所有對手的皇帝病危了，此時，他發現自己還是渴望曾經擁有的真情，但是晚了，所有的人都離他而去，包括他還愛著的甄嬛。

冷宮中，癡念皇帝的華妃還等著皇帝，然而，留給她的只有人亡愛逝的結果和歡宜香的真相。面對這個癡情女子，甄嬛感慨不已，傳下懿旨：讓華妃和其他愿意出宮的嬪妃離開皇宮。

杏花又開了，甄嬛也老了，而后宮中又開始了新的輪回……

人生天地，花開花落，憑誰做主？