高昌國王麴文泰受到欲谷設的威脅，被逼協助欲谷設出兵攻打焉耆，并封鎖一切向東的道路。焉耆的使者趕到大唐，向李世民報告了西域的戰事。 李世民緊急召集軍隊，向高昌進發，表面上是沖著高昌去的，實際上真正的目標是欲谷設。 麴文泰派出使者向大唐求和。李世民卻置之不理，隨即發兵開始攻打高昌。麴文泰知道此時已無力回天，他在唐軍到達之前因病辭世。侯君集的隊伍沒有遇到任何抵抗，就拿下了高昌。侯君集接收了麴文泰之子麴智盛的投降，將他押解回長安。 李世民平定了高昌。 侯君集仗著自己的軍功，態度十分傲慢，引起了不少人的忿恨。大家都覺得他是白白撿到攻占高昌的功勞。高昌平定不到十天，便有若干官員上書列舉侯君集在高昌的種種不當舉動，要彈劾侯君集。