THIRD-i終于找到Hornet，而且藤丸的一些證據讓他內心動搖，最終他說出了真正的幕后黑手，操縱一切的人其實就是蜘蛛，面對這個奪走了葵的生命，不知多少次把自己逼到窮途末路的蜘蛛，藤丸難掩心中的憤恨之情。這次魔彈之射手又從電視臺的播出系統上下手，促使年輕人聯合起來對九條總理進行體制批判，這樣他也終于啟動了“日本再啟動計劃”，讓日本為恐怖核彈頭疼，而且蜘蛛還侵入了THIRD-i的主系統，直接攻擊THIRD-i本部。就在此時，和響一起離開THIRD-i的藤丸竟然接到了蜘蛛的來電，對方充滿挑釁意味地告訴藤丸和他一起玩，藤丸怎么可能接受這樣的對待，他立刻開始偵查蜘蛛的所在地，最終鎖定了敵人蜘蛛電腦終端的所在位置，但是此時對方早已打開了榮譽之門。藤丸從監控錄像上看到了南海，南海也打算潛入調查，沒想到差點被倉野醫生殺死，原來她就是蜘蛛，可是當藤丸趕到時，倉野卻指證南海才是蜘蛛，還請求藤丸救自己。