雖然東條醫生為被神龍會的成員用刀刺傷了的直樹的哥哥和樹作了急救手術，但是情況不樂觀，和樹進入了嚴密監視狀態，不可以有絲毫的懈怠。此時，研究生廣田被什么人在研究所內殺害身亡了。雖然直樹非常擔心意識還沒有恢復的哥哥和樹的安危，但是還是拜托倫子照顧哥哥，自己出發去執行任務了。據推測，犯人是用鈍器將廣田殺害后，連電腦都毀掉了的，這種行為是不是為了消滅被害者的研究內容呢？但是，根據研究室的松江教授的說法，廣田并沒有在研究什么特別重要的課題。在現場還發現了與廣田交往的櫻送來的高級料理便當。櫻似乎在廣田被殺害之前來給他送過便當，但是無論倫太郎和直樹怎么問櫻都說她沒有來過，這讓兩個都不禁覺得她非常可疑。在技術專家理沙的努力下，被破壞的電腦復原了，從殘存的資料來看，廣田似乎和量子暗號裝置的開發有著關系。量子暗號裝置是安全局長吉村率領的富士山之會正在開發的一款反間諜活動的裝置。另外，還有傳聞說櫻是吉村的情婦。根據松江教授曾經將廣田的研究成果占為己有這一點來看，松江，櫻以及吉村都有殺害廣田的動機。此時，因為吸毒而被捕的某個未成年人聲稱自己殺害了廣田。根據枝刑警部長的說法，這樣這個案件就解決了，這件案件的調查正式結束。怎么看都覺得吉村控制著宮的父親安西的行動，因為安西的反對不得不與宮分手的村瀨少見的暴跳如雷。倫太郎告訴他可以根據自己的想法行動，于是他不顧刑警部長的命令，私下繼續對此案進行著調查。最近發生的幾起事件之間到底存在著怎樣的聯系呢？和樹的生命以及兄弟之間的關系又會如何發展呢？